佛顶宫位于南京市江宁区牛首山遗址公园。牛首山遗址公园项目规划设计范围东至宁丹路，西至大谷线，北到江宁行政边界，南到牛首祖堂景区分界线，总面积约10.8平方公里，其中核心区规划设计范围总面积约0.6平方公里。在规划上确定了“天阙藏地宫，双塔出五禅”、“一花五叶”的总体布局。

佛顶宫中已开放的一期项目包括“一路、一宫、一塔、一叶”四个区域。而其中更吸引眼球的便是位于布局中心的巨大穹顶——“佛顶宫”

整个佛顶宫总建筑面积近10万平方米，主体建筑共9层，地下利用矿坑建设了6层，规模宏大，可以说在世界上的佛教建筑中也是少见的。而这里就是安放和供奉佛顶舍利的地方。